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Base de datos de estructura de proteínas AlphaFold de DeepMindMin

Hace unos días, DeepMind (una empresa hermana de Google) lanzó su muy esperada base de datos de estructura de proteínas AlphaFold 2. Concretamente, el proyecto se llevó a cabo en colaboración con el Laboratorio Europeo de Biología Molecular (EMBL).

El proyecto AlphaFold original comenzó en diciembre de 2018. El artículo de Nature proporciona un resumen completo de este último avance. El CEO y fundador de DeepMind es el Dr. Demis Hassabis.

La compañía británica se dio a conocer a través de sus programas AlphaGo y AlphaZero. Estos programas aprendieron por sí mismos Go, Chess y Shogi jugando durante varios días. Luego pudiste derrotar a los mejores jugadores humanos y de supercomputadoras del mundo en estos juegos.

Estoy muy sorprendido de que ningún lector haya mencionado este avance innovador. Es probable que tenga efectos beneficiosos en futuros tratamientos de pérdida de cabello. Curiosamente, el lector “Quentin” recientemente hizo un comentario muy útil sobre los aminoácidos que están estrechamente relacionados con las proteínas.

Aspectos destacados de AlphaFold 2

Los aspectos más destacados de esta base de datos AlphaFold en línea de acceso gratuito incluyen:

“Este será uno de los conjuntos de datos más importantes desde el mapeo del genoma humano”. Dr. Ewan Birney (Director EMBL-EBI).

  • La herramienta de inteligencia artificial AlphaFold 2 de DeepMind ha proporcionado a 350.000 proteínas una estructura tridimensional.
  • Esto incluye un mapa de las alrededor de 20.000 proteínas que se expresan en el genoma humano. También conocido como proteoma.
  • AlphaFold ya está ayudando a los científicos a acelerar el descubrimiento de fármacos.
  • En los meses siguientes. DeepMind planea expandir significativamente la cobertura a casi todas las proteínas secuenciadas conocidas por la ciencia (más de 100 millones de estructuras en la base de datos UniProt).
  • Este trabajo computacional representa un avance asombroso en el problema del plegamiento de proteínas de 50 años en biología.
  • Cambiará todo (?).

“Con este recurso disponible de forma gratuita y abierta, la comunidad científica podrá aprovechar el conocimiento colectivo para acelerar el descubrimiento y marcar el comienzo de una nueva era de biología habilitada por IA”. Dr. Paul Nurse (Director del Instituto Francis Crick).

Proteínas contra la caída del cabello

Parece que esta tecnología está madura para acelerar el desarrollo de tratamientos anticaída. Y ayuda a comprender el motivo de la caída del cabello.

Durante mucho tiempo, muchas personas han sugerido que un régimen de pérdida de cabello no tiene por qué implicar solo la destrucción completa de (DHT). Por ejemplo, vea mi publicación sobre la proteína Krox20 (EGR2).

Esa es la única forma en que busqué “cabello” en la base de datos. Hubo 175 resultados:

Resultados de la búsqueda de proteínas AlphaFold 2.

Otros recursos de código abierto

Estamos viendo un número creciente de bases de datos en línea gratuitas y recursos de acceso abierto de los que los investigadores pueden beneficiarse en el tratamiento de la caída del cabello. Además del DeepMind / AlphaFold GitHub general, también tenemos otros específicos para el cabello como BiernaskieLab GitHHub.

También tiene recursos como skinregeneration.org de Driskell Lab, donde puede buscar grandes conjuntos de datos sobre cicatrices y tejido regenerativo. Vea mi publicación relacionada sobre regeneración de la piel, cicatrización de heridas y crecimiento del cabello.

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